Põhimääruse kohaselt suunab keskuse tegevust keskuse nõukogu. Nõukogu koosseisu kuuluvad keskuse
juhataja ja õppetooli juhataja ning üks keskuse töötajate poolt valitud esindaja ning kuni kolm
välisliiget, neist vähemalt üks väljastpoolt TTÜd. Keskuse nõukogu koosseis igaks õppeaastaks
kinnitatakse teaduskonna dekaani poolt keskuse juhataja esildise alusel.
Keskuse nõukogu liikmeteks on olnud Haridusministeeriumi kantslerid Veiko Jürisson ja Georg Aher
ning ministri nõunik Heli Aru; Haridusministeeriumi Riikliku Eksami- ja Kvalifikatsioonikeskuse
direktor Andres Adamson; Sotsiaalministeeriumist Aivar Soe, Pille Rebane ja Malle Kindel;
Tööturuametist Heiki Randma; Tallinna Pedagoogikaülikoolist professor Jüri Orn ja TTÜst
rektoraadi esindajana rektor professor Olav Aarna ja prorektor professor Jakob Kübarsepp,
humanitaar- ja sotsiaalteaduste instituudi direktorid dotsent Peeter Laido ning dotsent
Ilmo Saulepp ja majandusteaduskonnast tööteaduse õppetooli juhataja professor Eedo Kalle.
Humanitaarteaduskonna dekaan, professor Sulev Mäeltsemees, oma korraldusega 02.09.2005 H - 3/28 kinnitas 2005/2006. õppeaastaks haridusuuringute keskuse nõukogu alljärgnevas koosseisus:
Esimees - Väino Rajangu, haridusuuringute keskuse juhataja
Liikmed - Jakob Kübarsepp, TTÜ õppeprorektor
                 Teet Tiko, välisliige, Haridus- ja Teadusministeeriumi Koolivõrgu Büroo juhataja